| 序号 | 单位名称 |
| 1 | 北京市水文总站 |
| 2 | 北京市节水用水管理事务中心 |
| 3 | 北京市水生态保护与水土保持中心 |
| 4 | 北京市排水管理事务中心 |
| 5 | 北京市水科学技术研究院 |
| 6 | 北京市智慧水务发展研究院 |
| 7 | 北京市供水管理事务中心 |
| 8 | 北京市水资源调度管理事务中心 |
| 9 | 北京市河湖流域管理事务中心 |
| 10 | 北京市水务资产管理事务中心 |
| 11 | 北京市水务规划研究院 |
| 12 | 北京市水务应急中心 |
| 13 | 北京市水务建设管理事务中心 |
| 14 | 北京市水务局综合事务中心 |
| 15 | 北京水利医院 |
| 16 | 北京市水务局党校 |
| 17 | 北京市水务局政务服务中心 |
| 18 | 北京市水务局机关本级 |
| 19 | 北京市水利工程质量与安全监督中心站 |
| 20 | 北京水利水电学校 |
| 21 | 北京市水利工程管理中心 |