| 序号 | 单位名称 |
| 1 | 北京市水务局机关行政 |
| 2 | 北京水利水电学校 |
| 3 | 北京市水文总站 |
| 4 | 北京市水务应急中心 |
| 5 | 北京市水务局综合事务中心 |
| 6 | 北京市水务局党校 |
| 7 | 北京市清河管理处 |
| 8 | 北京市凉水河管理处 |
| 9 | 北京市排水管理事务中心 |
| 10 | 北京市节水用水管理事务中心 |
| 11 | 北京市水资源调度管理事务中心 |
| 12 | 北京市水务局政务服务中心 |
| 13 | 北京市南水北调大宁管理处 |
| 14 | 北京市南水北调团城湖管理处 |
| 15 | 北京市南水北调环线管理处 |
| 16 | 北京市南水北调干线管理处 |
| 17 | 北京市水科学技术研究院 |
| 18 | 北京市智慧水务发展研究院 |
| 19 | 北京市北运河管理处 |
| 20 | 北京市永定河管理处 |
| 21 | 北京市潮白河管理处 |
| 22 | 北京水利医院 |
| 23 | 北京市水利工程质量与安全监督中心站 |
| 24 | 北京市水生态保护与水土保持中心 |
| 25 | 北京市水务建设管理事务中心 |
| 26 | 北京市水务资产管理事务中心 |
| 27 | 北京市十三陵水库管理处 |
| 28 | 北京市官厅水库管理处 |
| 29 | 北京市密云水库管理处 |
| 30 | 北京市京密引水管理处 |
| 31 | 北京市城市河湖管理处 |
| 32 | 北京市供水管理事务中心 |
| 33 | 北京市水务规划研究院 |
| 34 | 北京市水务综合执法总队 |
| 35 | 北京市河湖流域管理事务中心 |